【9th.May】如何從根本上消除DNA測(cè)序中的錯(cuò)誤
日期：2019-05-09
閱讀：1267
題目：如何從根本上消除DNA測(cè)序中的錯(cuò)誤
報(bào)告人：黃巖誼教授，北京大學(xué)工學(xué)院，杰青
時(shí)間： 5月9日 (周四), 上午10:00
地點(diǎn)： 化學(xué)樓五樓518會(huì)議室
邀請(qǐng)人：任吉存 教授
摘要：
我們發(fā)展了一種全新概念的測(cè)序方法—糾錯(cuò)編碼測(cè)序法（簡(jiǎn)稱ECC測(cè)序法），該方法采取一種獨(dú)特的邊合成邊測(cè)序（SBS）策略，利用多輪測(cè)序過程中產(chǎn)生的簡(jiǎn)并序列間的信息冗余，大幅度增加了測(cè)序精度。通過全新設(shè)計(jì)的特殊測(cè)序反應(yīng)底物，對(duì)待測(cè)DNA序列進(jìn)行三輪獨(dú)立的SBS測(cè)序，繼而產(chǎn)生三條互相正交的簡(jiǎn)并序列編碼。這三條編碼可互為校驗(yàn)，后續(xù)不但能夠通過解碼推導(dǎo)出真實(shí)堿基序列信息，而且具備對(duì)單輪測(cè)序錯(cuò)誤位點(diǎn)的校正能力。通過和低錯(cuò)誤率的熒光發(fā)生測(cè)序技術(shù)相結(jié)合，我們?cè)趯?shí)驗(yàn)室搭建的原理樣機(jī)上獲得了單端測(cè)序超過200堿基讀長(zhǎng)無錯(cuò)誤的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
報(bào)告人簡(jiǎn)介：
黃巖誼，北京大學(xué)教授。1997年獲北京大學(xué)化學(xué)專業(yè)理學(xué)學(xué)士學(xué)位，2002年獲北京大學(xué)無機(jī)化學(xué)專業(yè)理學(xué)博士學(xué)位；2002-2005年在美國(guó)加州理工學(xué)院應(yīng)用物理系，2005-2006年在美國(guó)斯坦福大學(xué)生物工程系從事博士后研究工作?，F(xiàn)任北京大學(xué)工學(xué)院材料科學(xué)與工程系教授，北京大學(xué)北京未來基因診斷高精尖創(chuàng)新中心研究員，北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心研究員，北京大學(xué)-清華大學(xué)生命科學(xué)聯(lián)合中心研究員，北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院兼職教授。
